Deux mois avant que le premier malade ne soit officiellement recensé en Italie, le coronavirus était présent dans les eaux usées de Milan et de Turin, a annoncé le 19 juin l’Institut supérieur de la santé (ISS) italien, information relayée le même jour dans le journal Le Monde. Pour aboutir à cette conclusion, l'étude italienne a examiné 40 échantillons d’eaux usées, recueillis entre octobre 2019 et février 2020.

En France, le projet Obépine pour "Observatoire épidémiologique dans les eaux usées", porté par Eau de Paris en collaboration avec Sorbonne Université, le Syndicat interdépartemental pour l'assainissement de l'agglomération parisienne (Siaap) et l'Institut de recherche biomédicale des armées (Irba) a recherché la présence du génome viral dans les eaux usées de 30 stations d'épuration, entre le 5 mars, soit avant le confinement, et le 23 avril (cf dépêche TecHopital). 

Mais, "les exploitants français d'eaux usées, qu'ils soient publics et privés, ne conservent pas d'échantillons d'eaux usées dans leurs frigos",